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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00218 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  30 lines
  1. *******************************************
  2. * Phytochrome chromophore attachment site *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Phytochrome [1,2] is a  plant  protein that acts as a regulatory photoreceptor
  6. and which mediates red-light effects on a  wide  variety  of physiological and
  7. molecular responses.    Phytochrome  can  undergo a  reversible  photochemical
  8. conversion between a  biologically  inactive red light-absorbing  form and the
  9. active far-red light-absorbing form.   Phytochrome is a dimer of identical 124
  10. Kd subunits, each  of which contains a covalently attached linear tetrapyrrole
  11. chromophore.
  12.  
  13. The chromophore  is  attached  to  a  cysteine  which  is  located in a highly
  14. conserved region that can be used as a signature pattern.
  15.  
  16. -Consensus pattern: R-[AS]-[PV]-H-x-C-H-x(2)-Y
  17.                     [C is the chromophore attachment site]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20.  
  21. -Expert(s) to contact by email: Partis M.D.
  22.                                 partis@afrc.ac.uk
  23.  
  24. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  25.  
  26. [ 1] Silverthorne J., Tobin E.M.
  27.      BioEssays 7:18-23(1987).
  28. [ 2] Quail P.H.
  29.      Annu. Rev. Genet. 25:389-409(1991).
  30.